目前，對常駐代表機構(gòu)征稅主要有三種計算方法。
第一種：按實計算征稅。常駐代表機構(gòu)能夠提供簽定的合同、傭金率等全部資料、憑證，并且建有帳冊，進行財務(wù)收支和成本費核算，其中，境外費用支出部分還能夠提供當?shù)刈詴嫀熥C明的，經(jīng)稅務(wù)機關(guān)審查同意，可以按其申報的實際收入額計算征稅。
第二種：核定收入額計算征稅。常駐代表機構(gòu)如果僅能提供在中國境內(nèi)從事居間介紹，代理等簽訂的全部合同資料，但合同中沒有載明傭金金額（或者屬于同一常駐代表機構(gòu)的多項業(yè)務(wù)合同，其中一部分合同載明傭金金額，一部分合同沒有載明傭金金額），不能提供準確的證明文件和正確申報收入額的；或者不能提供準確的成本、費用憑證，正確計算應(yīng)納稅額的，經(jīng)稅務(wù)機關(guān)審查同意，可以用核定收入額的方法計算征稅。
第三種：按經(jīng)費支出額換算收入計算征稅。常駐代表機構(gòu)未能提供有效的合同、協(xié)議等憑證資料，正確區(qū)分應(yīng)稅業(yè)務(wù)活動和不征稅活動；或者代表機構(gòu)經(jīng)常與總機構(gòu)共同向客戶提供各項服務(wù)，未能提供有效資料、憑證，正確劃分代表機構(gòu)與總機構(gòu)應(yīng)分享的收入額；或者代表機構(gòu)不能提供準確的證明文件，區(qū)分其中自營商品貿(mào)易還是代理商品貿(mào)易及其他未能準確申報收入額的，稅務(wù)機關(guān)可依照營業(yè)稅暫行條例實施細則第十五條的規(guī)定，采用按經(jīng)費支出換算收入方法確定收入額并據(jù)以征收營業(yè)稅。
